郑成功是我国台湾省历史的重要人物，但没被神格化，没有形成信仰，究其原因是清廷克台，明郑是战败一方，因此民间只能偷偷摸摸，不敢堂而皇之膜拜，以致不能蔚为风潮。

至晚清，统治基础底定，官方才建祠纪念。日治时期，因郑氏是半个日本人，所以盖了庙宇。蒋介石时期，因和郑成功一样遭遇，遭官方大力表彰，奉为为民族英雄。但民进党时代去中，郑成功地位又悄悄下滑。郑成功崇拜，从民庙到官祠，起起落落更迭而起伏。

郑成功得入祀官祠，是沈葆桢的努力，同治13年（1874）因牡丹社事件，日本侵扰屏东满州，清廷派福建船政大臣沈葆桢巡阅台湾，官衔钦差办理台湾等处海防兼理各国事务大臣，沈氏对台湾的贡献是重新调整行政区域，健全官治，开山抚番，废渡台禁令，强化海防，而在台南更留下两座历史建物：亿载金城、延平郡王祠。

沈葆桢抵台南，地方仕绅建议可否奏请追谥郑成功，并准建祠，钦差大臣愿意出面替前朝藩王，而且是对抗的一方请命，可要很大的勇气，但沈葆桢同意了，并以之上奏，朝廷准奏，谥忠节，建祠府城，春秋两祭，南明诸臣114人配享。沈葆桢并书对联：开万古得未曾有之奇，洪荒留此山川，作遗民世界。极一生无可如何之遇，缺憾还诸天地，是创格完人。

上联描述台湾，下联品题郑氏，沈葆桢果有胆识，将郑成功无法复明郁死台湾，称为缺憾，这可要很大勇气，若有小人参奏，又是一番风波，而称郑氏为创格完人也是厚道，古今成大事者，必有瑕有疵，完人只能养花莳草、闭户读书，哪能成就大事。

日本统治时期，郑成功因日本血统被日本绑上战车，1895年，日本总督桦山资纪即献力挽回澜匾予延平王庙，隔年总督桂太郎将延平王庙改为开山神庙，成为台湾第一座神庙。

抗战胜利后，郑成功因矢志反攻被易名为延平郡王祠，1950年蒋介石赠匾振兴中华。