首先，《东京教父》这部电影动画中，传说耶稣降临人间，三个来自东方的旅者受到星星的指引来到圣子身边，为他献上礼物。旧瓶装新酒，女婴清子的出现为三个流浪人指引了回家的路：大叔赌博负债不愿意面对家人，抛弃妻子和孩子；少女因为心爱的猫被父亲扔掉，愤怒中失手捅伤父亲，不敢面对家人；哈娜从小被父母抛弃，一面都不曾见过，后来在酒吧唱歌打伤客人，为了不惹麻烦离开。

流浪的人不问身世，如果没有捡到清子，一切或许不会改变。大叔建议直接送到警察局，哈娜对清子爱不释手，虽然恋恋不舍，也同意为她找到父母，亲自问问他们为什么抛弃孩子，或许那个理由可以让她对自己的父母释怀。在为清子找父母的途中，他们第一次触到彼此的身世。

没有钱去墓地找食物，大叔喝了黑社会老大奠祭的酒，接下来就救了差点被车碾到的黑社会老大，意外得到了清子母亲的线索；大叔发现黑社会老大的女婿是逼自己还债的人打算动手，意外撞到了伪装成服务生的杀手，女婿挡在黑社会老大前挨了枪；杀手走前绑架了女孩和清子，哈娜去追，大叔认为有警察可以不管，两个人在这里分开，开始了各自的故事线。

女孩和清子被带到了异国杀手家里，女同伙对她们很好，在这里引出了少女的身世，哈娜后来接走了她们；大叔捡到了一个老流浪汉，照顾他到临终，意外发现清子父母的住址线索，后来被不良少年打了一顿，抢回了被拿走的给女儿攒的三万日元，伤重被酒吧老板娘捡了回去。哈娜走投无路求助之前工作的酒吧老板娘，意外与大叔重逢。在这里引出了哈娜的恋人的故事，因为洗澡踩到了肥皂去世，人生真是无常，后来她就开始了流浪。有了线索，三个人继续寻找，然而那个地方已经是废墟，大叔后来在废墟里发现了新地址。

哈娜因为营养不良住进医院，大叔在这里遇到了女儿，也戳破了大叔编造的妻女去世的故事。哈娜为了让他回到家庭，像青鬼那样离开，故事又变成了两条线。哈娜不知道准确地址，在清子父母住址附近晃悠的时候，遇到了想跳河的清子母亲，成功还回了孩子；同时大叔继续为清子找父母，按照地址找到男人后发现，清子居然是他妻子从医院拐走的孩子，那个女人不是清子的母亲。