由重庆医科大学第一附属医院的Wanqian Li发表的名为“iPSC-based model of Vogt-Koyanagi-Harada disease for phenotype recapitulation and drug screening”的论文中,研究人员通过虚拟筛选从ChemBridge的化合物数据库中筛选获得了全新的能够改善Vogt-小柳-原田综合征的抑制剂。
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Vogt-小柳-原田综合征是一种主要由黑色素细胞自身免疫引起的综合征,目前其发生发展机制仍然是个谜。重庆医科大学的研究者通过对与自身免疫功能密切相关的EGR2蛋白进行化合物的虚拟筛选,从ChemBridge虚拟筛选化合物库的近140万个化合物中筛选出了三个候选的EGR2激动剂,并在Vogt-小柳-原田综合征(VKH)模型中验证了其效果。
研究者首先对ChemBridge虚拟筛选化合物库的1390000个化合物进行分子对接高通量虚拟筛选,找到了417000个可能结合的化合物。然后对该系列化合物,在标准精度模式下进行筛选,评分前200的化合物作为潜在的激动剂继续进入下一阶段。随后,研究者综合了结合模式、药物化性和可用性等指标,筛选出50个化合物。最后根据Lipinski’s 规则,选出了三个候选化合物。
图1:新型EGR2激动剂筛选流程。
随后,研究者通过分子对接预测了这三种化合物与EGR2蛋白的结合方式,结果显示,这三种化合物对EGR2蛋白均有很好的结合。
图2:三个候选化合物的分子对接模拟EGR2蛋白结合结果。
为了验证这些化合物具有EGR2的激动活性,研究者进行了进一步实验,从mRNA水平在Vogt-小柳-原田综合征(VHK)模型中观察三个候选化合物的活性。实验发现:化合物CQMU98能够显著增加EGR2的表达水平,有最好的激动活性。
图3:三个候选化合物的分子对EGR2的mRNA水平影响。
最后,研究者在EGR2蛋白水平以及细胞自噬两个水平上对化合物CQMU98进行评价,结果显示,CQMU98化合物能将VHK模型中下调的蛋白回复到正常水平,并且增加了细胞自噬,帮助细胞清除异常物质。
图4:CQMU98调控Vogt-小柳-原田综合征蛋白并促进细胞自噬。
在本研究中,研究者提出EGR2激动剂在改善Vogt-小柳-原田综合征中的应用价值。随后,研究者进行物虚拟筛选,通过对多个指标的综合评价并从ChemBridge虚拟筛选数据库中筛选出一系列新型EGR2激动剂,并从mRNA水平检测了这些激动剂的活性,结果显示CQMU98的活性最强。最后,研究者发现CQMU98能够从蛋白水平和细胞水平上调控相关蛋白并激活细胞自噬,从而改善Vogt-小柳-原田综合征。