金厦海域翻船案的两名生还渔民回到大陆后，其中一人含泪控诉渔船是被台海巡艇撞翻。面对渔民控诉，台海巡署没拿出录影来反驳，反改口称在驱离和翻船过程中没有录影，但承认两船多次碰撞。

两名生还渔民星期二（20日）下午从金门返回厦门，随后回到泉州。两名死者的家属则对验尸结果有疑虑，拒绝火化遗体，目前还在金门。

事发隔天（2月15日）台海巡署副署长张忠龙称，涉案大陆渔船蛇行拒检，不慎翻覆，没提碰撞。随后，海巡署以侦查不公开为由拒绝交出事发录影，台海洋委员会主委管碧玲则称，追缉录影约五分钟，决定先交检调部门调查，过后才公布。

星期三（21日）下午一名回到大陆的渔民叙述事发经过时说，当天中午12时出发，12时50分就看到台海巡艇冲着他们的船开过来渔民称：我们自己船怎么可能翻掉？开急转弯也翻不掉，要被撞才会翻掉。台海巡艇冲一下把我们顶翻掉了，我们就钻到水里面跑出来，四个人只有两个人上岸。他感慨说：我们两边的渔民打渔，我们没对他怎么样，他们以前跑到我们这边来，我们对他们很好。这次他们对我们这样，太失望了。

台海巡署星期三晚上也针对渔民指控发出四点声明，包括虽然无法全程录影，但不影响事实真相，并指两名生还渔民在调查笔录中表示，对海巡队执法程序无异议。