自从前苏联解体之后，俄罗斯的潜艇数量急剧缩减。1985年时，前苏联海军拥有208艘各种型号的核潜艇，这些核潜艇上总共装载了982枚弹道导弹和1946枚巡航导弹，它们活跃在世界各大海洋。前苏联潜艇装备的潜射战略导弹，其总的爆炸威力为1.71×10^9吨当量，相当于第二次世界大战末期美国轰炸日本广岛的原子弹爆炸当量的15万倍。但是，到1991年以后，由于军备大规模缩减，俄罗斯海军拥有的战略核潜艇数量急剧减少。到1998年时，俄罗斯海军拥有26艘各种型号的弹道导弹核潜艇，这些弹道导弹核潜艇上总共装载了440枚弹道导弹，核弹头总数为2272枚。
1993年，俄罗斯制订了新一代战略导弹核潜艇“北风之神”级的发展计划，1996年开始建造。“北风之神”级潜艇为俄罗斯第四代战略核潜艇，又称955型战略核潜艇，由圣彼得堡红宝石中央设计局设计。
在“北风之神”级潜艇的发展中，俄罗斯也一再遭遇困难。在1996年“尤里·多尔戈鲁基”号龙骨铺就后，由于配备导弹的改变，设计图纸也不得不做相应调整，这使潜艇的建设费用不断攀升。正是由于上述原因导致“尤里·多尔戈鲁基”号潜艇的完工时间从计划的2002年一再推迟。直到2008年，“尤里·多尔戈鲁基”号潜艇才正式下水，2009年夏天开始才进行海试。
“尤里·多尔戈鲁基”号核潜艇，长172米，艇体宽为13米，吃水深11米，水面最大航速15节，水上航行排水量为14700吨，水下航行排水量达24000吨，最大下潜深度为450米，人员编制130人。
与美国现役“俄亥俄”级战略核潜艇比较，“尤里·多尔戈鲁基”号潜艇的最大下潜能力比之深150米。机动能力方面，“尤里·多尔戈鲁基”号的主动力装置为1座OK-650型压水核动力反应堆和2座汽轮机，采用双轴推进。强劲的核动力装置保证水下航速可以达到29节，超过“俄亥俄”级潜艇的25节航速。
指挥和预警方面，“尤里·多尔戈鲁基”号装备了“公共马车”型自动作战指挥系统和“斯卡特”型综合声呐系统，将多功能数字声呐系统、推进设备、导航设备和鱼雷(导弹)发射控制站位连接为一个整体，实现高智能、全自动、一体化指挥。
为了确保水下航行静音性能“尤里·多尔戈鲁基”号的艇体结构为拉长水滴型流线造型设计，减少艇体与水流之间的摩擦，降低航行噪音。艇体表面贴敷了厚度超过150毫米的高效消声瓦。主机安装了整体浮筏式双层减振基座及隔音罩，另外还装有2个低噪音泵式推进器，实现水下低航速静默航行。潜艇在以15～25节的巡航速度航行时，噪声水平可以减少一半左右。此外，为了确保长期潜伏，该潜艇自主巡航时间可达100个昼夜，可实现对目标的突然袭击。
作为核威慑战略布局中的王牌，“尤里·多尔戈鲁基”号最惹人关注的无疑是其战略核打击武器——“圆锤”潜射洲际弹道导弹。起初俄罗斯为“北风之神”级核潜艇设计了全新的“巴尔克”导弹，但该导弹在试验中接连失败，迫使俄罗斯最终放弃了该导弹的发展，而改由设计了“白杨”M导弹的莫斯科热力工程研究所重新设计，这就是著名的“圆锤”导弹为了完成潜射导弹的试验，俄罗斯将最后一艘“台风”级潜艇改装为“圆锤”导弹的试验艇，并从2005年开始进行了一系列发射试验。
“尤里·多尔戈鲁基”号核潜艇装有16个战略导弹发射筒，将配备16枚“圆锤”导弹，每枚导弹可携带多达10枚10万吨当量的分导核弹头，每个弹头可以独立瞄准目标。“圆锤”能够在高空实施变轨，突破美国“国家导弹防御系统”。不过，该导弹在起初完成了3次水面和水下的弹射试验后，从2006年9月开始，“圆锤”导弹在实弹试验中连续3次失败。俄罗斯也改变了计划试验的次数，2009年12月进行的导弹试射又一次失败，这将导致“北风之神”级潜艇真正形成作战能力的延迟。甚至有专家悲观地预测说，该级潜艇由于没有合适的导弹，可能会面临被拆毁的命运。
“北风之神”级潜艇计划建造8艘，第二艘“亚利山大·尼维斯基”号和第三艘“弗拉基米尔·莫诺马基”号已经分别于2004年3月和2006年3月开工建设，但是在导弹试射多次失败后，原计划于2009年12月开工建设的第四艘却并未如期进行龙骨铺设仪式。
除了“北风之神”级弹道导弹核潜艇外，俄罗斯海军正在建造的潜艇还有“亚森”级攻击型核潜艇以及“圣彼得堡”级常规动力攻击型潜艇等。
1992年，俄罗斯开始建造“亚森”级核动力多功能攻击型潜艇，该级潜艇的建造计划又被称为885计划。该级潜艇的第一艘“北德文克斯”号最初计划1998年之前服役，但资金问题使得建造工作一直到2001年才重新启动。2003年后随着经费的增加，建造进度加快，“北德文克斯”号已经于2009年12月完工，并做好准备进行海试。2010年5月7日，“北德文斯克”号在北方造船厂举行了下水仪式，在进行相关的导弹发射试验后，该潜艇就会交付北方舰队，正式加入俄罗斯海军进行服役。
“亚森”级潜艇的水面最大航速为16节，水下最大航速为31节，艇体长119米，宽13.5米，高9.4米，艇员数量为90人，下潜深度可达600米。“亚森”级潜艇为了增强其隐身性能，潜艇使用了特殊的材料，俄罗斯官方称“亚森”级潜艇将会是世界上最安静的潜艇。
俄罗斯一位海军中将表示“亚森”级潜艇是俄罗斯海军历史上第一艘真正的多功能潜艇，可以完成海军所有的特殊海上任务，例如打击水下、地面和空中目标。该级潜艇的首舰“北德文克斯”号潜艇装备有24枚巡航导弹，包括“阿尔法”潜射巡航导弹、SS一NX—26或SS—N—21潜射巡航导弹。此外，该艇还装备有8个鱼雷管以及水雷和反舰导弹，如SS-N一16“种马”反舰导弹。
根据2009年12月俄罗斯国防部向媒体透露的消息，在未来的8年时间里，俄罗斯计划建造至少6艘“亚森”级潜艇，并且，该级潜艇的第二艘“喀山”号已于2009年7月24日（俄罗斯海军日）开始建造。
与“北德文斯克”号潜艇相比，“喀山”号潜艇将会进行较大的改装，主要是由于该级潜艇的设计已经完成了15年，类似无线电电子等领域的系统需要升级，此外，为了减少对前苏联地区供应商的依赖，俄罗斯将努力使该潜艇只装备在俄罗斯完成建造和组装的系统和材料。
俄罗斯在发展核潜艇的同时，依然坚持发展常规动力的潜艇。长期以来，外界对俄罗斯海军的第4代常规动力潜艇677工程“拉达”级(出口型称为“阿穆尔”级)就总是充满兴趣。
“拉达”级潜艇设计方案的首次公开亮相是在1993 年的阿布扎比防务展上，当时俄罗斯展出了“拉达”级小型常规潜艇的设计模型，以便了解外国专家的意见和潜在客户的需求。在红宝石设计局的展台上，“拉达”级潜艇的模型放在“基洛”级877型与636型潜艇模型中，显得非常小，但却引起了外国媒体和部分国家海军官员的注意1997年12月26日，位于圣彼得堡的海军上将造船厂开工建造首批2艘“拉达”级潜艇，为纪念圣彼得堡这座为前苏联/俄罗斯海军做出巨大贡献的城市，首制艇被命名为“圣彼得堡”号。然而由于资金不能及时到位，建造工作进程缓慢，下水时间也一推再推。到2003年6月，红宝石设计局宣布，“圣彼得堡”号潜艇已完成85%的建造工作，但原希望2003年11月下水的计划已无法实现，推迟至2004年4月。然而到了这个日期仍然没有动静，又过了6个月，直到2004年10月28日，“拉达”级潜艇的首制艇“圣彼得堡”号在位于圣彼得堡的海军上将造船厂下水，从而揭开了笼罩在它头上的神秘面纱。
2009年3月20日，俄罗斯海军副总参谋长奥列格·博尔采夫说，以噪音低见长的首艘“拉达”级柴电潜艇“圣彼得堡”号将于2010年正式开始服役。“拉达”级潜艇开启了俄罗斯常规潜艇发展的新篇章。
2024年俄罗斯“雅库茨克”号大型柴电潜艇11日在圣彼得堡下水，这是俄海军接收的最后一艘636.3型柴电潜艇。636.3型柴电潜艇属俄罗斯基洛级改进型第三代常规潜艇。该型潜艇长73.8米、宽9.9米，航速达20节，最大潜深300米，自持力45天，潜艇乘员52人，潜航排水量4000吨，战斗力较之前型号有大幅提高。
