土壤结构影响花椒根系水平分布和深层分布，进而影响树体正常发育及结果实。疏水的土壤孔隙度适中，空气含量适当，适宜根系的延伸和花椒的生长发育，湿润沙壤土和中壤土花椒生长最好，具有强大根系，地上部分生长健壮，结实较多。种植花椒的土壤一般翻耕20cm，土壤厚度80cm左右即可基本满足花椒的生长。土层过浅,特别是干早山地会使根系缺水和少养分而使树体矮小，早衰，导致减产、品质降低。
2、土壤肥力
花椒对土壤适应性强，贫瘠土壤可生长，但深厚肥沃、质地疏松、保水保肥性强、各种养分比较充足的土壤更能保证花椒的生长和结实，实现连年丰产。通过翻压绿肥施有机肥料和无机肥料不断提高土壤肥力。在千旱缺水地区更要在采摘后施用基肥。
3、酸碱度
花椒对土壤酸碱度适应范围很广，一般pH6.5~8范围内的土壤上都可栽培，但以pH7~7.5生长和结果好。花椒喜钙，在石灰岩山地上生长特别好。
4、土壤水分
花椒根浅耐涝性差。土壤含水量过高或排水不良都会影响花椒的生长和结实。
5、地形
地形中坡向、坡度、海拔高度等外部环境条件对花椒的长势、产量有影响。坡向影响光照长短，在山下地势开阔、背风向阳的地方花椒生长较好;山坡到山顶较差。坡度影响土壤肥力。地势陡，径流量大，流速快，冲刷力大，造成土壤肥力降低。坡度越大一般花椒的生长发育就越差。同样品种的花椒一般平原地区不如山区长得好，质量高。海拔高度影响水、热、风等气候条件，进而形成不同的土壤理化性质和光照条件，对花椒生长发育产生不同的影响。
