论文荐读
共识序列改造提高南极假丝酵母脂肪酶B的热稳定性
作者:
王亚婵1,2 李阳阳1,2 刘松1,2*
单位:
1. 粮食发酵工艺与技术国家工程实验室(江南大学)
2. 江南大学 生物工程学院
基金项目:
国家重点研发计划项目(2021YFC2101400)
摘要&关键词
摘要:南极假丝酵母脂肪酶B(Candida antarctic lipase B,CALB)对水溶性和非水溶性底物均有良好的催化效率,广泛应用于各种工业领域,例如,生物柴油、对映体酮洛芬、甘油碳酸酯等的合成。为提高CALB热稳定性,将CALB与48条不同来源的脂肪酶序列进行比对获得共识序列,并初步确定了可显著提升CALB保守性的14个突变位点。随后,通过定点突变获得热稳定性显著提升的组合突变体G114A/A284N(CALBm)。结果显示,与CALB相比,CALBm在50 ℃下的半衰期提高了74.7%,达到14.5 min,但比酶活(16.1 U/mg)和kcat/Km[5 932.3 mmol/(L·min)]分别下降了36.3%和23%。分子动力学模拟表明,增加的疏水相互作用(G114 vs M83,G114 vs V84,G114 vs I121)和氢键(A284 vs G41,A284 vs A281)提升了CALBm蛋白分子的整体刚性和稳定性。分子对接分析显示,CALBm与底物分子之间作用力的减少可能是其活性降低的主要原因。研究结果将有助于提升CALB高温条件下的应用效果。
关键词:脂肪酶B;共识序列;热稳定性;酶学性质;分子动力学模拟;分子对接
主要结论
为满足工业生产的需要,提高CALB的热稳定性,本研究将南极假丝酵母来源的脂肪酶B(GenBank:Z30645.1)与48条不同来源的脂肪酶序列进行比对。选择对CALB热稳定性有潜在影响的14个点进行突变,并有序叠加,分析确定了热稳定性显著提升的组合突变体G114A/A284N(CALBm)。
a-CALB 及突变体纯化后的残余酶活和比酶活;b-组合突变体的残余酶活和比酶活
图1 残余酶活和比酶活变化
同时测定了CALB和CALBm的比酶活、kcat/Km及50℃下的半衰期(t1/2)。与CALB相比,CALBm 在50℃下的半衰期(t1/2)提高了74.7%,达到14.5 min,但比酶活(16.1 U/mg)和kcat/Km[5932.3 mmol/(L·min)]分别下降了36.3%和23%。最后,对突变前后氨基酸与周围氨基酸之间的相互作用进行分析。结果表明,新增加的疏水相互作用(G114 vs M83,G114 vs V84,G114 vs I121)和氢键(A284 vs G41,A284 vs A281)在一定程度上增加了CALB的刚性,促使热稳定性的提升。
表1 CALB和CALBm性质比较
图2 突变位点的相互作用力变化
本研究通过多序列比对,得到对CALB热稳定性有潜在影响的点进行突变,获得热稳定性提升的突变体CALBm,并对热稳定性提升的原因进行了分析。研究结果将有助于提升CALB高温条件下的应用效果。
团队介绍
通信作者
刘松,江南大学未来食品科学中心研究员,硕士生导师。从事工业酶分子改造和食品级微生物(链霉菌、曲霉等)表达系统的开发。近年来在Biotechnology Advances、ACS Synthetic Biology、Journal of Agricultural and Food Chemistry及Bioresource Technology等生物工程类SCI期刊上发表研究论文40余篇,出版英文专著1部(副主编);授权发明专利40余项,其中国际专利4项;主持国家自然科学基金(面上项目2项、青年基金项目1项)、江苏省自然科学基金、国家重点研发计划子课题、863子课题等纵向科研项目及10余项横向课题;获得中国轻工业联合会科学技术进步奖一等奖(2018),中国商业联合会科学技术奖一等奖(2017)和特等奖(2022)。2022年8月,任中国食品科学技术学会酶制剂分会理事。
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