开学了!先来学习怎么样使用激光共聚焦吧!
超级分辨率的指南
2024-09-08 14:24:00
一秒跳进大学生活 激光共聚焦显微镜 共聚焦显微镜 实验室日常 医学研究生日常 生物学研究生 线粒体
一篇文章就足够了,教你怎么样设置拍出完美共聚焦!无论是哪一家的共聚焦显微镜,说到底一张共聚焦图像的质量,主要是有这几个因素共同决定的:1、激光通道、 2、接收滤光片波段范围;3、激光强度;4、增益(Gain);5、pinhole(针孔大小);6、扫描的分辨率;7、其他设置(平均次数Averaging或驻留时间 Dwell time)。
怎么样去设置才能拍到一张图像不过曝,细节丰富,又没有噪声的共聚焦图像呢?
第一步,根据我们的染料或荧光蛋白确定激光通道。例如GFP蛋白,使用488通道进行激发。
第二步,根据染料的激发与发射光谱。选择合适范围的滤光片波段,例如GPF蛋白,可选500-550范围。一般来说,滤光片比激发光波段高一段就行。
PS:前面两步比较简单,因为基本上大家的染料或者蛋白选定了,基本上就确定了。重点是接下来的3个参数,如何去选择!
激光强度、增益、pinhole!
简单地说,这三者越大,信号越强,但是各有利弊。
激光强度越大,信号越强,但是样本漂白更严重。
增益越大,信号越强,但是噪声噪点会很大!(这个值很关键,如果拍出来噪声很多,基本上就是这个值拉太大了)。
Pinhole越大,信号越强,但是理论上光学分辨率越差(准确的说应该是离焦层信号越多,也就是光学选层能力越差,所以pinhole越小,分辨率越高,但是同时信号会被遮挡的更多,图像越暗)。
我一般喜欢的调节思路是:
先把pinhole调到默认1个单位。然后把增益调到10%;激光强度调整到20%左右。点开live观察信号,如果此时信号很亮,则继续调小增益,调到5%,甚至0.5%或者0.2%。只要信号足够强,增益可以足够小,越小信噪比越好。
如果这时候信号依然很强,就可以调低激光强度和pinhole。
如果增益调到5%(这个值不一定就是5%,根据样本来)已经很弱,则尝试增大激光强度和pinhole,看能否把信号提亮。
确定好增益、激光强度、pinhole之后,在拍摄前,把分辨率调整到2048*2048、适当增加平均次数Averaging或驻留时间 Dwell time,比如增加到2或者4,可以再稍微让噪声更加干净一些,但是同时扫描速度会变慢。
对于共聚焦来说,图像质量很大程度上和成像速度是反比,想要一张图清晰,信噪比高,往往意味着扫描速度要慢。而增益调大会让图像充满噪声,所以我习惯调低这个值,适当增加激光强度和pinhole。
0
阅读:0
admin
点赞!
懒洋洋
牛学到了