奇门遁甲法以九宫为本，六甲或称六仪仅能居其中六宫，所余三宫，则用乙丙丁来表示。此乙丙丁便是“三奇”。对于这“三奇”的由来，存有两种说法。《遁甲演义提要》言道：“日生于乙，月明于丙，丁为南极，视为星精，故而乙、丙、丁皆视为奇。”此即乙为日奇，丙为月奇，丁为星奇。这是其一说法。

其二说法为，乙乃甲妹，为救甲，舍身作庚金之妻，使庚之情愫受到牵制，丙丁为甲之子女，因其熊熊烈火，使庚金受克制而难以肆虐。它们皆为救护至尊至贵的甲作出贡献，故而以乙丙丁为三奇。

此外，十干之中，戊己庚辛壬癸乙丙丁在九宫中皆有专位，而甲无专位，与戊己庚辛壬癸六干共处，即上述甲子同六戊，甲戌同六已，甲申同六庚，甲午同六辛，甲辰同六壬，甲寅同六癸，仅剩余乙丙丁三位孤寂零仃，无人相陪。这亦是称乙丙丁为“奇”的一层意义。故而有些奇门遁甲典籍言：“受甲者为仪，不受甲者为奇。”于遁甲法式中，“三奇”与“六仪”皆代表时间。

“门”指休、生、伤、杜、景、死、惊、开八门。其中开、休、生三门最为吉祥。休门在坎一宫属水，生门在艮八宫属土，开门在乾六宫属金，历家将之称为“三白吉门”。门意味着方向。若乙为日奇，丙为月奇，丁为星奇，且乙丙丁三奇遇到开休生三吉门，此乃奇与门合。这是一种可给人带来顺遂、祥瑞与成功的组合。若奇与门再有吉星高照，更加吉不可言。

奇门遁甲之法式，需布天、地、人三盘，以求得奇（时间）与门（方向）的绝妙组合，同时寻觅吉星高照，以实现人们的诸般追求。奇与门乃人们心之所向的目标，而遁甲则是追寻这一理想目标的方法。二者相互融合，遂成就了这门奇术之名——奇门遁甲。