关于高句丽灭国后的民族流向问题，国内外学者进行过讨论和研究，也存在一些分歧。有的学者认为高句丽灭国后，大多数留在了朝鲜半岛和中国东北，与当地各族人民相融合。最近，有的学者著文认为高句丽灭国后主要迁入中原或留在中国东北，绝大多数融进了汉族。

公元668年9月，李世勣率兵攻入平壤城，擒王灭国。同年10月，李世勣携宝藏王、男产及高句丽王公贵族回唐朝都城。李治于城门亲自迎接凯旋之师，盛况空前。12月，唐朝议定对高句丽俘虏的态度：因宝臧大权旁落已久，赦免其罪，赏司平大常伯员外同正；男产为司宰少卿；僧信诚为银青光禄大夫；男生升为右卫大将军；男建则流放黔州。高句丽遗民就地安排，将原来五个部落、一百七十六座城、六十九万户分重新划分，设九个都督府、四十二个州、一百个县，府州县统归平壤的安东都护府管辖。安东都护府的职能主要是对高句丽地区的人民进行管理，执行安抚政策，并征收赋税，一旦有外敌入侵，马上出兵征讨。府州县的长官由高句丽军中有功劳者充任，唐人参理。都护一职，由右威卫大将军薛仁贵担任，设兵两万，以作镇抚之用。从汉至唐，存在九百多年的高句丽至此灭亡了。

高句丽亡国时居民69万户，并不都是高句丽族人，而有不少是高句丽统治下的其他各族人，他们并没有融入高句丽族中。而高句丽族户数据史学家考证推算，认为是15万户，大约70多万人。

那么，这15万户高句丽人在高句丽灭国后，其去向怎样？据史书记载，大体可分为四种情况：入中原、入突厥、入靺鞨、入新罗，余者则为在辽东、平壤“遗人”和死亡的。

具体情况如下：入中原各地的高句丽人，以后都加入汉族。迁高句丽人口到内地，在唐太宗亲征高句丽时已进行。贞观十九年（645年）九月十八日下令班师，让人“拔”辽州、盖州、岩州的居民，迁居中原地区，前后达7万多人。高句丽灭亡后，唐高宗李治鉴于高句丽遗民多有反抗活动，下令将3.83万户高句丽人，以每户5口计算，计有19万多人，迁到（长）江、淮（河）以南以及山南（秦岭以南）京西（肃省）各州空旷地区居住。

据《三国史记》中记载：“公元669年，夏四月，高宗移三万八千三百户於江滩之南及山南、京西诸州空旷之地”。如果每户同样按照4~5人计算的话，应该在十五万三千二百人至十九万一千五百人之间。根据《新唐书》中的记载，高句丽的末代王高臧来到长安，仪凤二年（677），唐朝授予他“辽东都督”的官职，封他为朝鲜郡王，仍旧回到辽东以安抚那里的百姓。但高臧不甘心失败的命运，回到辽东后又与靺鞨勾结，密谋东山再起，结果叛乱还没来得及发动就以失败告终。高藏和大批族人们又被遣返至中原的河南、陇右等地，剩一些贫弱者留在辽东。这批移民的数量在史料中没有确切记载，但从文献记载来看，应该超出了第一次内迁时。这些到中原的高句丽遗民后来逐渐和汉族、中原其他民族融为一体。唐朝政府派泉盖苏文的长子泉男生前往安抚辽东地区的高句丽遗民。泉男生推行仁政，改置州县，广招流民从事生产，使高句丽遗民生活安定下来。公元679年，泉男生积劳成疾，病死在官舍中。唐高宗感念他的功劳，特意为他立碑记功。

高句丽人还有南投新罗和西人突厥的，而更多的居民或自愿投入或由于领土变迁成为靺鞨族所建立的渤海国的居民。其中散奔突厥的高句丽人迁入辽西，融入汉族。突厥是兴起于6世纪中叶的中国北方部落国家。高句丽的安藏王去世后，有些高句丽“旧户”或遗人分投突厥。

高句丽人还有一个投奔方向就是入靺鞨。这里所指的靺鞨是“居最南，抵长白山……与高丽接”的粟末靺鞨和白山靺鞨。该部靺鞨愿受高句丽役属，除被迫向他交纳贡赋外，还得参加战争。高句丽灭亡之后，这部分靺鞨曾随高句丽遗民被移居营州（今辽宁朝阳市）一带。他们在该地区受唐文化的影响而日趋汉化。但他们留恋故土，于公元696年，粟末靺鞨和白山靺鞨首领率其众及“高句丽种”一起东走，渡过辽河，向东北腹地进发。公元698年，粟末靺鞨部长之子大祚荣于牡丹江流域东牟山，即今吉林省敦化敖东城（又名鄂多里城）建立震国，后称渤海国。显而易见，高句丽人作为渤海国核心力量的一部，占有很大的比例。

南投新罗有两种情况，一是因某种原因而自动投奔的，如高句丽末代王高藏王的庶出儿子安胜率领4000余户，约2万人投奔新罗国。另有，唐高宗咸享二、三年（671、672年）高句丽部落首领长剑牟岑奉安舜为领袖，外引新罗为援举行反唐叛乱。当叛军被唐军击败后，平壤城已经残破无法驻守，许多高句丽人逃到新罗国。二是高句丽人随其居地被新罗人占有而成为新罗人口的，其数量也是不小的。高句丽的一些“旧城往往没于新罗”，而当唐朝廷将安东都护府治所从平壤迁到辽东后，新罗国就开始占有了从大同江以至元山湾沿线以南广大地区，在这片广阔土地上没有迁走的高句丽居民自然也就成为新罗国的居民了。因此，高句丽族的四个流向中，加入汉族的就占三份，汉族成为高句丽的主流了。流入新罗的高句丽人和原来居住在大同江流域的高句丽人，以后大都融入到新罗族中，成为今天朝鲜族的一部分，这是高句丽人的第二个重要流向。高句丽人流人突厥的为数不多，不占主要地位。

总之，据史学家研究表明，在15万户约70多万高句丽人的流向中，迁居中原各地的近30万人，散奔、归入靺鞨（渤海）的占10万人以上，投入新罗的约10万人，散奔突厥的达万余人，再加上散居辽东半岛、平壤及其以北地区的“遗人”，战争中死亡的人，人数与高句丽原总人数基本一致。由此可见，过去认为高句丽人的后裔都是朝鲜族的说法是错误的。高句丽的后裔，不仅不都是今朝鲜族，而且朝鲜族也不是高句丽人后裔的主流。相对来说，加入汉族的高句丽人比加入朝鲜族的高句丽人倒是多一些。