1954年，身为西南军区公安部队副政委的郭林祥，接到工作调动，让他在军政委与四川军区副政委之间选择。对于职务的选择，他更愿意到作战部队担任政委，到前线去。

从职务来说，他从副军职提拔为正军职，算是提拔。如果担任四川军区副政委算是平级调动，还是晋升呢？

很多人或许认为四川军区是省级军区，也就是军级单位。但在1955年之前，并非正军级单位，而是兵团级单位。

新中国成立后，很多兵团兼任各省军区，如7兵团兼任浙江军区，10兵团兼任福建军区，5兵团兼任贵州军区，3兵团兼任云南军区。但四川军区属于特例，在1952年之前，四川划分川东、川南、川北、川西，四个区相当于四个省的行政单位。此后，合并为四川，建立四川军区，贺炳炎担任司令。

就在郭林祥选择去16军任政委时，贺炳炎找到他，希望他留在四川协助他工作。

郭林祥在战争年代显得“默默无闻”，可在解放后的大西南军区工作，成为不可或缺的干部。原本他只是川北军区副政委，西南军区压倒性的剿匪工作，让他有机会展示能力，别人都是军事干部，采取军事为主，他作为政工干部，采取政治为主，攻心为上，不仅减少伤亡，而且取得不错的成绩，受到军区首长的表扬嘉奖。

此后，贺老总又点名让他到黑山剿匪，这里是少数民族聚集地，单纯靠军事手段，会影响民族团结。因此上级希望用政治为主，军事为辅来，考虑到他有这方面的经验，就让他做剿匪总指挥，要啥给啥，调度一切。最终胜利完成任务，中央领导得知也进行表扬。

这也是贺炳炎多次挽留他的原因，贺炳炎是带兵出身，在军事指挥方面没问题，而四川需要有一位有能力的干部帮助他。政委李井泉因为在地方工作，无暇顾及军区。他的再三邀请，让郭林祥不好意思再提去16军工作，贺老总得知后也给郭林祥做工作：贺炳炎打仗不要命，工作上的事你多管管。

因为当时，四川凉山地区还有匪患没解决，而这里是少数民族聚集地，要军事打击、政治争取，发动群众集合起来。俩人一个会打仗，一个会政治工作，可谓是相得益彰。经过大小战斗13次，歼灭土匪1000余人，到1955年5月，一举完成凉山地区多军事占领任务。

1955年4月，上级宣传撤销6大军区，四川军区改为成都军区（兼任四川省军区），贺炳炎为司令，李井泉为政委，副司令为李文清、何正文、副政委阎红彦、郭林祥。

郭林祥成为副军级少将中，最早称为大军区副职的将领。因为李井泉负责地方工作，军区的政治工作依然由郭林祥具体负责。

1959年，郭林祥被提拔为成都军区第三政委，成为少将中第二位担任大军区正职的将领。