AI-动力血液检测:癌症早期检测实现跨越飞跃

拉拉康康 2024-06-17 10:35:11

一种新的人工智能方法在从血液测试中检测肿瘤DNA方面取得了突破,显示出高灵敏度和准确性。这项被称为MRD-EDGE的技术可能会彻底改变癌症的早期检测和监测,包括肺癌、乳腺癌、结直肠癌和癌前病变。它通过提前数月甚至数年识别癌症复发,为传统方法提供了一个跨越进步。

研究人员开发了一种人工智能方法,可以显著提高血液中肿瘤DNA的检测,增强癌症的早期检测和监测。这种被称为MRD-EDGE的方法通过比传统方法更早地识别复发,在肺癌、乳腺癌和结直肠癌中显示出很高的有效性。

一种新的人工智能检测血液中肿瘤DNA的方法在预测癌症复发方面显示出前所未有的敏感性。这项新技术有望改善癌症治疗,早期发现复发,并在治疗过程中密切监测肿瘤反应。这项突破性研究由威尔康奈尔医学院、纽约长老会、纽约基因组中心(NYGC)和纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSK)的科学家领导。

人工智能增强癌症早期检测

6月14日发表在《自然医学》杂志上的这项研究中,研究人员表明,他们可以训练一种机器学习模型,一种人工智能平台,根据患者血液测试的DNA测序数据,以非常高的灵敏度和准确性检测循环肿瘤DNA(ctDNA)。他们在肺癌癌症、黑色素瘤、癌症、癌症和癌前结直肠息肉患者身上成功演示了这项技术。

“我们能够实现显著的信噪比增强,例如,这使我们能够在标准临床方法之前数月甚至数年检测到癌症复发。”该研究的共同通讯作者、威尔康奈尔医学院血液学和医学肿瘤学系医学教授、纽约基因组中心核心教员Dan Landau博士说。

该研究的共同第一作者和共同通讯作者是Adam Widman博士,他是Landau实验室的博士后研究员,也是MSK的乳腺癌症肿瘤学家。其他共同第一作者是纽约基因组中心的Minita Shah、奥胡斯大学的Amanda Frydendahl博士以及纽约基因组中心和威尔康奈尔医学院的Daniel Halmos。

液体活检技术的进展

液体活检技术在实现其巨大前景方面进展缓慢。迄今为止,大多数方法都针对相对较小的癌症相关突变,这些突变在血液中的存在往往过于稀疏,无法可靠地检测到,导致癌症复发而未被发现。

几年前,Landau博士及其同事开发了一种基于血液样本DNA全基因组测序的替代方法。他们表明,他们可以通过这种方式收集更多的“信号”,从而实现对肿瘤DNA更敏感、逻辑上更简单的检测。从那时起,这种方法越来越多地被液体活检开发者所采用。

在这项新研究中,研究人员再次领先,使用先进的机器学习策略(类似于ChatGPT和其他流行的人工智能应用程序)来检测测序数据中的细微模式,特别是将暗示癌症的模式与暗示测序错误和其他“噪音”的模式区分开来

癌症检测与监测的高灵敏度

在一项测试中,研究人员训练了他们的系统,他们称之为MRD-EDGE,以识别15名癌症患者的患者特异性肿瘤突变。在患者接受手术和化疗后,该系统根据血液数据预测,有9人患有残余癌症。其中五名患者在一个月后被发现,采用了不太敏感的方法——癌症复发。但没有假阴性:MRD-EDGE认为没有肿瘤DNA的患者在研究窗口期内没有复发。

MRD-EDGE在早期肺癌癌症和癌症三阴性患者的研究中显示出相似的敏感性,早期发现除一例复发外的所有复发,并跟踪治疗期间的肿瘤状态。

研究人员证明,MRD-EDGE甚至可以检测到癌前结直肠腺瘤的突变DNA,结直肠腺瘤是结直肠肿瘤发展的息肉。

Landau博士指出:“目前尚不清楚这些息肉是否会脱落可检测的ctDNA,因此这是一个重大进展,可以指导未来检测癌前病变的策略。”他也是威尔康奈尔医学院桑德拉和爱德华·迈耶癌症中心的成员,也是纽约长老会/威尔康奈尔医学中心的血液学家/肿瘤学家。

最后,研究人员表明,即使没有对患者肿瘤测序数据进行预先训练,MRD-EDGE也可以在使用标准X射线成像检测前几周检测到黑色素瘤和癌症患者对免疫疗法的反应。

Landau博士强调:“总的来说,MRD-EDGE解决了一个巨大的需求,我们对其潜力感到兴奋,并与行业合作伙伴合作,试图将其提供给患者。”

来源:威尔康奈尔医学院

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