PC|Sli基因的新功能化使马铃薯自交亲和从而促进其精确育种

智农云芯看智能农业 2024-04-02 09:27:06

早前,荷兰瓦赫宁根大学的Ernst-Jan Eggers等在nature communications上发表了题为“Neofunctionalisation of the Sli gene leads to self-compatibility and facilitates precision breeding in potato”的文章,将显性S位点抑制剂(Sli)基因引入二倍体马铃薯种质中产生马铃薯自交系,为马铃薯的精确育种提供遗传稳定性。

doi : 10.1038/s41467-021-24267-6

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主要缩略词

自交不亲和系 (SI)自交亲和系 (SC)配子体自交不亲和系 (GSI)

显性S位点抑制剂 (Sli) 基因

具有孢子体作用的花粉表达基因纯合子致命

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该研究构建了遗传图谱,进行了QTL分析,并在75号染色体的长臂上发现了一个非常显著的QTL定位位点(LOD = 72.12)。

图1:群体17SC11中的QTL映射和重组分析

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为了验证Sli在花粉中表达的假设,在体外从10个SI和10个SC马铃薯基因型中萌发花粉,并提取RNA进行RNA测序。得出结论,只有PGSC2DMG0003基因在SC植物的花粉管中特异性表达。

图2.SC和SI基因型发芽花粉的RNA测序

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为了进一步确认PGSC0003DMG400016861确实是Sli,我们设计了一个表达结构,其中包含Sli的SC等位基因在其天然启动子和终止子之间的外显子。

图3.Sli转基因和CRISPR-Cas9敲除系的表型分析

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分析表明,其中一个基因的SC等位基因在SC基因型的花粉中特异性表达。最后,使用转基因表达和CRISPR-Cas9诱导的敲除,我们最终表明PGSC0003DMG400016861是Sli。研究表明MITEs可以以组织特异性的方式上调近似基因,但需要更多的研究来证明Sli启动子中MITE的存在是其花粉特异性表达的原因。

本研究设计了一个CRISPR-Cas9构建体,转化了两种SC基因型(B665和B663),获得了149种转化的再生体,最后,使用转基因表达和CRISPR-Cas9诱导的敲除,证明该蛋白在自交亲和植物的花粉中特异性表达。在该基因的启动体中插入533 bp导致功能突变的获得,从而克服了自花粉排斥,引导马铃薯自交亲和有助于其精确育种。

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