工伤员工不配合接受做工伤认定或者拒绝治疗，这样对员工非常不利，公司申请工伤认定的流程也难以推进。如果该员工又反过来要求公司赔偿相关费用，应该如何处理？

一、工伤认定期限根据规定，公司应该在员工事故发生后的一个月内进行工伤认定申报，而员工个人则有一年的申报时间。如果员工未能在一年内申请工伤认定，其意外事件将不被认定为工伤，并无法要求公司赔偿。二、员工不予配合认定工伤的依据如果公司能够证明是员工不予配合是导致延迟申报工伤认定的，那么因延迟申报所产生的费用应由员工个人承担。公司可以保留员工个人不予配合认定工伤的相关证据，比如向员工发送要求配合的书面文件并要求员工签收。

如果员工始终不愿意进行工伤申报，则员工的意外事件不属于工伤范畴，员工无权要求公司赔偿。若此后员工提出赔偿要求，公司可根据具体情况依法处理。

如果规定期限内员工仍不予配合，导致公司无法申报工伤，公司就能证明员工的不配合，并可要求员工承担因此产生的相应后果。若没有以上证据材料，企业则需要承担所有工伤医疗费用。

在处理此类劳资关系工作时，企业应当正确引导员工并告知其相应的后果，以促进员工积极配合企业的相关工作。同时，在日常工作中，企业也应当做好相应的员工管理工作。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第四十三条

工伤职工有下列情形之一的，停止享受工伤保险待遇：(一)丧失享受待遇条件的;(二)拒不接受劳动能力鉴定的;(三)拒绝治疗的。