ChIP后的WB多重要?
近些年来,越来越多的期刊杂志对WB结果进行严格要求。比如:“提供未经编辑的WB原始图像”、“进行条带间比较分析时,应在同一张膜上”、“不接受高对比度的WB图片”等,部分期刊杂志甚至要求“提供未经裁剪的WB全膜图像”!WB检测不仅是期刊杂志的重要审核对象,也在一定程度反映了ChIP实验的好坏。读懂ChIP后的WB结果,能让我们对于实验有更清晰的判断、更有底气。
ChIP后的WB怎么看?
这个结果就非常不错:从左往右共有10条泳道。最右边的泳道是Marker,标记蛋白分子大小。左边的9条泳道划分为3个生物学重复(红框标记),每个生物学重复有3条泳道,分别是Input、IP、IgG。Input:ChIP实验前取部分样品,不经免疫沉淀,用于检测样品中目的蛋白的表达。IP:利用特异性抗体进行免疫沉淀。与IgG对比,说明免疫沉淀过程目的蛋白是否被显著富集,图中IP使用H3K4me2抗体。IgG:阴性对照。使用IgG代替特异性抗体进行免疫沉淀,用于排除其他因素(非特异结合)对ChIP实验的影响。由上图可知:Input显示样品中目的蛋白有表达。并且IP相较IgG,目的蛋白经免疫沉淀,存在显著的、特异性富集。ChIP实验十分成功!(注:抗体重链条带为加入二抗孵育时,因二抗结合一抗、IgG的重链而产生,55KD附近)。至此,ChIP-seq完成了最关键的一步。有了这张漂亮的ChIP后WB检测结果图,理想的文章成果也不再遥远。最终,上述结果发表在Cellular & Molecular Immunology(IF24.1)上。ChIP-seq成果展示(节选)
TF 发表于Redox Biology(IF11.4)
Histone modification 发表于Nature Communications(IF16.6)