2024年诺贝尔化学奖的揭晓,不仅是对科学界一次盛大的庆典,更是对人工智能在科学研究中应用的肯定。今年的奖项授予了David Baker、Demis Hassabis和John Jumper三位科学家,以表彰他们在蛋白质结构预测和设计领域的卓越贡献。特别是Hassabis和Jumper共同主导开发的AlphaFold,这一人工智能工具不仅刷新了我们对蛋白质结构的认知,更在生物医药领域掀起了一场革命。
蛋白质是生命的基石,它是由氨基酸通过肽键连接而成的有机化合物,在生命体中扮演着多种多样的作用。人体的头发指甲、肌肉、免疫细胞甚至病毒都是蛋白构成的,但这些蛋白之间的作用却全然不同,决定蛋白质功能的关键就在于蛋白质的结构。因此,解析蛋白质的结构一直是科学家们探索生命奥秘的关键一环,也是人类实现百病不侵的密码。
然而,解析蛋白质的结构却并不容易。蛋白质具有极其丰富的结构。一个蛋白小的由几百个氨基酸构成,大的由上百万个氨基酸构成,中间一个氨基酸发生改变,蛋白质的结构就全然不同。
过去解析一个蛋白质的结构,通常利用X光衍射、冷冻电镜等工具,这些设备不仅每台价值千万元,而且耗时巨大。一个研发团队通常要花几年的时间才能解析出一个蛋白质结构。然而人类已知的蛋白质种类有上百万种,利用传统方法解析的蛋白质不过是沧海一粟。
在这样的背景下,AlphaFold的横空出世无疑是一场及时雨。AlphaFold是DeepMind公司开发的一款基于人工智能的蛋白质结构预测工具,它能够从蛋白质的氨基酸序列出发,直接预测出蛋白质的三维结构,且精度达到了原子级别。
在2020年新冠病毒广泛传播的时候,AlphaFold仅仅用了几周的时间,就成功解析出新冠病毒的关键蛋白结构,大幅地缩短了疫苗的开发周期。这一成就的背后,是深度学习算法的强大威力与海量基因组学数据的完美结合。
AlphaFold的诞生并非一蹴而就。自2016年DeepMind的围棋AI AlphaGo战胜世界冠军李世石后,Hassabis便意识到,同样的技术或许可以应用于更广泛的科学挑战中。于是,他组建了一个跨学科团队,致力于将深度学习应用于蛋白质结构预测这一生物学难题。经过数年的艰苦研发与不断迭代,AlphaFold终于在2018年首次亮相,并在国际蛋白质结构预测竞赛(CASP)中一鸣惊人。
随后的几年里,AlphaFold不断进化,从初代版本到AlphaFold2,再到能够预测蛋白质复合物结构的AlphaFold-Multimer,其预测精度和范围都在持续提升。2021年,DeepMind与欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)合作,发布了涵盖数百万种蛋白质结构的预测数据库,供全球科研人员免费使用。这一举措极大地推动了蛋白质科学及相关领域的研究进展。
随着2024年诺贝尔化学奖的揭晓,我们迎来了科学历史上的一个崭新里程碑。David Baker、Demis Hassabis和John Jumper三位科学家的杰出贡献,不仅彰显了人工智能在科学研究中的巨大潜力,更开启了蛋白质科学的新纪元。AlphaFold的成功,不仅仅是技术上的突破,更是对人类探索生命奥秘勇气与智慧的生动诠释。它让我们看到了未来生物医药、疾病治疗乃至整个生命科学领域的无限可能。
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